Lalu pada tahun 1999 masyarakat provinsi Timor Timur melakukan referendum guna menentukan nasibnya sendiri hasilnya sebanyak lebih dari 78% penduduk Timor Timur memilih untuk memisahkan diri dari Indonesia di tahun 2002.
provinsi ini resmi lepas dari Indonesia dan menjadi sebuah negara dengan nama negara Timor Leste juga disayangkannya.***